1. 定义

　　“蛋白质组学”一词于 1995 年首次出现，被定义为对细胞系、组织或生物体所有蛋白质的大规模表征。

　　今天，蛋白质组学有两种定义，将基因产物的大规模分析限制在仅涉及蛋白质的研究中。

　　第二个也是更具包容性的定义，将蛋白质研究与具有 genetic readout 的分析相结合，例如 mRNA 分析、基因组学和酵母双杂交分析。

　　然而，蛋白质组学的目标保持不变，即通过研究细胞的所有蛋白质而不是单独研究每个蛋白质来获得更全面和综合的生物学观点。

　　2. 蛋白质组

　　蛋白质组是在有机体、系统或生物环境中产生的一组蛋白质。例如，我们可以指一个物种（例如人）或一个器官（例如肝脏）的蛋白质组。蛋白质组不是恒定的；它因细胞而异，并随时间而变化。在某种程度上，蛋白质组反映了潜在的转录组，但是除了生产率之外，蛋白质活性还受到许多因素的调节。

　　3. 蛋白质组学

　　许多信息不能仅从基因研究中获得。例如，决定细胞表型的是蛋白质，而不是基因。仅仅通过研究基因组是不可能阐明疾病、衰老和环境影响的机制的。只有通过对蛋白质的研究，才能表征蛋白质修饰并确定药物靶点。